爱知县卫生研究所的铃木老师们开发的PCR -根据ORF Typing(POT法)的基础,“genius鹿®分子疫学分析POT套件(黄色葡萄球菌用)”,开发出了。
本配套元件多路PCR运用,多数特定基因放大,同时在琼脂糖凝胶电泳分离、进行检测。检测出的放大乐队的图形分析的MRSA克隆简便推定。
特长
约4小时的分子疫学分析可能
脉冲电场凝胶电泳(PFGE)不同的通用设备测定可能
解析结果数值化(POT值)的事,菌体间的相比较可能同性
配套元件的构成
|
个别名称 |
容量 |
数量 |
试剂A |
AptaTaq DNA主人(5×Conc .)* |
1.0毫升 |
一本书 |
试剂B |
PCR附录 |
1.0毫升 |
一本书 |
试剂C |
引物混合α |
0.5毫升 |
一本书 |
试剂D |
混合β引物 |
0.5毫升 |
一本书 |
试剂E |
积极控制 |
1.0毫升 |
一本书 |
试剂F |
6×装入缓冲区(BPB·XC) |
1.0毫升 |
一本书 |
* AptaTaq DNA主人(5×Conc设置Roche Diagnostics K . K .的商品。
操作步骤
① |
金黄色葡萄球菌块儿的(培养) |
② |
DNA抽出,进行模板DNA制备 |
③ |
两种多路PCR |
④ |
琼脂糖凝胶电泳 |
⑤ |
乐队的读取模式 |
差 |
POT值的计算 |
⑦ |
各样品的POT值的比较分析 |
解析
电泳模式
50 : 50个基点DNA梯形P:积极的控制1:ATCC®700699(MRSA钥匙,50)2:ATCC®BAA – 1556(MRSA USA 300)3:ATCC®43300(MRSA)4:ATCC®25923(MSSA)5:ATCC®29213(MSSA)6,7:集体感染事例1中所得到的临床分离股票8,9:集体感染的事例2从中得到的临床分离股票
爱知县卫生研究所匡弘铃木老师的厚意,通过电泳模式的实例数据为您提供领受了。
检测ORF的种类(目标区域)及其PCR扩增产物尺寸
|
POT No . |
放大尺寸(bp) |
目标领域 |
Reactionmixture 1 |
femA |
601 |
positive control <em>aureus S .</em> |
POT 1 – 1 |
530 |
mecA |
POT 1 – 2 |
增加到449 |
<em>mec</em> gene complex class B |
POT 1 – 3 |
355 |
SCC <em>mec</em> typeⅡb specific |
POT 2 – 1 |
304 |
Tn <em>554</em> |
POT 2 – 2 |
271 |
职业噬菌体 |
POT 2 – 3 |
228 |
职业噬菌体 |
POT 2 – 4 |
197 |
职业噬菌体 |
POT 2 – 5 |
161 |
职业噬菌体 |
POT 2 – 6 |
131 |
职业噬菌体 |
POT 2 – 7 |
106 |
职业噬菌体 |
POT 2 – 8 |
81 |
Genomic Island |
Reactionmixture 2 |
femA |
601 |
positive control <em>aureus S .</em> |
POT 1 – 4 |
477 |
cassette chromosome recombinase A 2 |
POT 1 – 5 |
388 |
遗传背景 |
POT 1 – 6 |
320 |
遗传背景 |
POT 1 – 7 |
273 |
<em>mec</em> gene complex class A |
POT 3 – 1 |
243 |
职业噬菌体 |
POT 3 – 2 |
197 |
职业噬菌体 |
POT 3 – 3 |
171 |
职业噬菌体 |
POT 3 – 4 |
140 |
职业噬菌体 |
POT 3 – 5 |
115 |
职业噬菌体 |
POT 3 – 6 |
95 |
职业噬菌体 |
POT 3 – 7 |
78 |
职业噬菌体 |
①2个多路PCR的电泳结果从乐队读取模式。
②这电泳乐队的有无的结果用,POT值分析用EXCEL表二进法输入,3个类别的POT值计算出。
无论femA阳性的情况,那个样品黄色葡萄球菌,可以确认。另外,MRSA的场合,POT 1的值的合计为64以上。
不论样品之间的POT值进行比较,菌体间的相同性客观的推测。
在集体感染得菌身体,POT 1~3的POT值全部同一。
范畴 |
样品号码 |
1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
6 |
7 |
8 |
9 |
POT 1 |
93 |
106 |
95 |
6 |
4 |
93 |
93 |
73 |
73 |
POT 2 |
255 |
77 |
136 |
16 |
58 |
190 |
190 |
156 |
156 |
POT 3 |
96 |
113 |
66 |
35 |
112 |
103 |
103 |
120 |
120 |
产品信息
产品名 |
包装 |
产品编号 |
鹿genius®分子疫学分析POT套件(黄色葡萄球菌用) |
一包(120次) |
08180 – 96 |
一包(30回) |
08180 – 97 |
鹿genius®DNA抽出试剂 |
一包(120次) |
08178 – 96 |
最新的价格是Cica – Web请参照。
本试剂盒是从爱知县专利许可,制造销售。其他厂家的商品相关的许可证、专利方面,各厂商请确认。
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24080 – 96 |
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宣传手册、说明书(PDF)
小册子鹿genius®分子疫学解析套件(黄色葡萄球菌用)(352 KB)
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